蓮太郎和延珠再度和影胤對峙。影胤釋放出絕對防御之盾，而蓮太郎以自己真正的力量與他對抗。影胤是為了殺戮而被製造出來的影胤，他為了證明自己的存在意義而渴望鬥爭，蓮太郎無法認同他的想法，兩人產生劇烈的衝突。然而，就像在嘲笑他們兩人激烈決戰的結果一樣，階段V的腸原動物出現了。
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2022年開發出次世代主機『NERvGear』，人類終於將虛擬實境完全實現。而虛擬遊戲『Sword Art Online(SAO)』受到世界矚目。當遊戲正式開放後，SAO的開發者茅場晶彥卻向所有玩家宣布：「這款遊戲在破關前無法登出，玩家於遊戲內死亡也等同於現實肉體的死亡。」
桐人、尤吉歐、愛麗絲。自從兩名修劍士和一名整合騎士打敗最高祭司亞多米尼史特蕾達已過了半年。愛麗絲回到故鄉，在她身旁的是，不只失去摯友、自己也失去了手臂和心的桐人。然而，讓整個裏世界陷入悲劇的《最終負荷實驗》正一步步推進著。刀劍神域最淒美的一戰，最終章即將拉開序幕！
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桐人和亞絲娜約在東京的皇居見面，兩人談論著現實與虛擬世界的不同。此時，在線上遊戲Gun Gail Online中，發生有人在遊戲裡受到槍擊，現實中也心臟衰竭的奇特案件。政府「假想課」的課員菊岡調二郎找上了桐人，希望他能潛入Gun Gail Online與兇手接觸...。
桐人依舊沉眠於精神世界的深處，《闇神貝庫達》加百列卻用策略讓現實世界中的上萬美國玩家登入到裏世界。亞絲娜等人則是使用三個創世神名號的超級帳號與之對抗。這場大戰的結果攸關究極人工智慧還有人類的未來。而掌握關鍵的人，就是那位沉睡的少年──《黑色劍士》。Alicization篇，於本季迎接完結！
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在首都西部的這個城市中，「超能力開發」被列為學校課程的一部分。上條當麻因為寄宿在他右手的力量，被評價為吊車尾的「無能力」，直到從天而降的修女改變了他的日常生活。科學與魔法將數度度交鋒，一切都將發生巨大的改變！
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蓮是在槍與鋼鐵的世界《Gun Gale Online》一個人盡情遊玩的女性玩家，她最喜歡可愛的東西，全身的裝備也統一都是粉紅色。因為遇到某件事讓蓮發現PK的樂趣，被別人稱為「粉紅色的惡魔」。如此的蓮，遇到了漂亮又神祕的玩家Pitohui，她在Pitohui的建議下，參加了組隊混戰的活動「特攻強襲」。
面對突如其來的全新團隊對抗死亡對決大賽，蓮、Ｍ、不可次郎、Pitohui所組成的最強團隊《LPFM》也將參戰。等待著熱門奪冠候補的他們的是……「隨著時間逐漸淹沒的領域」、「潛藏在MAP中央的【UNKNOWN】區域」、以及「無名團隊的結盟」等嚴苛條件。另外，所有玩家也即將迎來令人震驚的特別規則——。
在未來人人都使用名為「Neuro-Linker（神經連結裝置）」的終端設備連線。因身材肥胖而受到欺凌的學生有田春雪，過著一邊詛咒現實，一邊提升壁球遊戲的分數最高紀錄的日子。某天，美麗的副學生會長黑雪公主邀請他加入「加速」的網路世界，他的生活就此改變…
