「我」睜開眼睛後，轉生成一隻蜘蛛。剛出生沒多久就遇上同類相食的慘況，連自己的小命都被母蜘蛛盯上，實在太沒有天理了！意志力超強的女高中生（？）的異世界生存戰揭開序幕！
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平凡的上班族相澤梓，因工作過度過勞死。她轉生到異世界，成為不老不死的魔女亞梓莎。鑑於前世的經驗，她在邊境的高原開始悠閒的慢活。打倒史來姆賺取金錢，像個魔女般製作藥物照顧山腳下的村莊。她持續過這樣的生活，被稱為「高原的魔女大人」。300年後，持續打倒史來姆累積的經驗值，讓亞梓莎在不知不覺間成為LV99，也就是世界最強。
遊戲玩家鄧不利夫的世界出現異常變化。出現了原本在遊戲裡沒有的味覺及嗅覺，也無法登出。這完全就是遊戲確切化為現實的證明。更誇張的是，鄧不利夫由於各種情況變成了年幼又美麗的少女模樣！為了解開謎團，鄧不利夫自稱是賢者的弟子米菈展開冒險，等著她的終點究竟是——？
曾在日本身為社畜，卻在年紀輕輕過勞死的主角相澤梓，在女神的幫助下，以不老不死的魔女之姿轉生異世界。為了彌補前世的缺憾，她下定決心悠閒過活，長年來都只以打倒史萊姆和製藥維持著平靜的生活。誰知三百年後，她累積的經驗值已讓她成為了LV.99的世界最強魔女，她的生活也開始逐漸發生變化。
線上遊戲《THE NEW GATE》。因玩家數眾多而熱鬧至極的虛擬世界突然發生劇變，將人們囚禁在遊戲世界中，折磨著他們。為了打破這種痛苦的現狀，身為遊戲內最強玩家的一名青年──進決定挺身而出。阻擋在他面前的，是這個世界最強大的敵人「原初」。
十多年前，世界各地突然出現連接異次元與現實世界的「傳送門」，而被稱之為「獵人」的覺醒者也相繼出現。「獵人」們利用其自身能力，攻略傳送門內的地下城並以此為業。而在眾多強大獵人當中，有位被稱為人類最弱兵器的下級獵人：成振宇。某一天，他在地下城中負傷瀕死之際，面前突然出現了一道神祕任務視窗。危急關頭選擇了接受任務的振宇，發現自己有了「升級」的能力...
修學旅行途中，在巴士上睡著了的高遠夜霧，被同班同學壇之浦知千佳叫醒了，乘坐的巴士被龍襲擊了。這裡居然是異世界！在莫名其妙的情況下突然陷入危機。但是夜霧擁有著這個世界基準所無法計量的「秒殺能力」！讓全部的敵人瞬間死亡！最強主角橫空出世！
十多年前，全世界各地毫無預警地出現連接異次元與現實世界的「傳送門」，從傳送門出現的怪獸與魔物無法被人類現代化武器消滅，唯一能與魔物抗衡的唯有一部分人類中出現的能力覺醒者,他們被通稱為「獵人」。覺醒後的獵人們有能力等級的高低，一旦覺醒後就不再改變,獵人們運用本身的特殊能力，攻略各個傳送門後方的地下城。主角成振宇原本是實力最弱的 E 級獵人，被笑稱：「人類最弱兵器」，迫於現實,他不得不進入地下城奪取魔物身上的魔晶石養家，卻每次都是重傷而回，在某一次進入雙重地下城之後，成振宇在九死一生的情況下獲得了別人沒有的特殊能力......
2022年開發出次世代主機『NERvGear』，人類終於將虛擬實境完全實現。而虛擬遊戲『Sword Art Online(SAO)』受到世界矚目。當遊戲正式開放後，SAO的開發者茅場晶彥卻向所有玩家宣布：「這款遊戲在破關前無法登出，玩家於遊戲內死亡也等同於現實肉體的死亡。」
桐人、尤吉歐、愛麗絲。自從兩名修劍士和一名整合騎士打敗最高祭司亞多米尼史特蕾達已過了半年。愛麗絲回到故鄉，在她身旁的是，不只失去摯友、自己也失去了手臂和心的桐人。然而，讓整個裏世界陷入悲劇的《最終負荷實驗》正一步步推進著。刀劍神域最淒美的一戰，最終章即將拉開序幕！
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桐人和亞絲娜約在東京的皇居見面，兩人談論著現實與虛擬世界的不同。此時，在線上遊戲Gun Gail Online中，發生有人在遊戲裡受到槍擊，現實中也心臟衰竭的奇特案件。政府「假想課」的課員菊岡調二郎找上了桐人，希望他能潛入Gun Gail Online與兇手接觸...。
桐人依舊沉眠於精神世界的深處，《闇神貝庫達》加百列卻用策略讓現實世界中的上萬美國玩家登入到裏世界。亞絲娜等人則是使用三個創世神名號的超級帳號與之對抗。這場大戰的結果攸關究極人工智慧還有人類的未來。而掌握關鍵的人，就是那位沉睡的少年──《黑色劍士》。Alicization篇，於本季迎接完結！
