城市「新威尼斯」是以21世紀前半為止，存在於地球的義大利水都威尼斯為參考原型，所建造的港都，它們有一個代表城市形象的偶像行業，就是歷史悠久，專門帶觀光客遊覽的「領航員」。新威尼斯正值鋪上落葉地毯的秋天。在橘色行星展開實習日常的阿妮亞，有一件非常在意的事情。
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【喚石篇】夏目在森林中遇見小妖怪－「三美」，據它說，它身負著名為「喚石」的職責，負責將具備神格名叫「岩鐵」的妖怪從沉睡中喚醒。【可疑的訪客】田沼身邊出現一位不可思議的客人。每天都會出現在他身邊，只跟他說了一些話便離去。夏目得知該位客人的真實身分是妖怪後，雖然很擔心田沼，但田沼本人卻對跟妖怪的交流樂在其中。
以星球的生命力「艾特納」能量誕生的魔人「虛」，在長久的歲月中輪迴重生，是不老不死的怪物。一度短暫顯現的人格是曾經開設松下村塾，引導幼年銀時等人的老師：吉田松陽。為了輔助銀時等人，新八、神樂、真選組、歌舞伎町的人們，甚至連過往的勁敵都將參戰！
夏目貴志從小就經常看到怪東西，也就是人類俗稱的妖怪。夏目一直以來備受其擾，自從搬到遠房親戚塔子阿姨的家後，與妖怪們的互動居然愈來愈多。無意間，夏目得到一本由外婆留下的妖怪名冊，並且常常聽到「夏目大人，請把名字還給我吧！」，為了取回友人帳裡的名字，妖怪們總是日以繼夜的前來…
高中生夏目擁有看的見妖怪的秘密能力，繼承了外婆留下了一本「友人帳」，上面記載著被收服的妖怪的名單。因父母早逝而寄住在各親威家的夏目，輾轉回到外婆曾生活著的阿姨家後，「友人帳」上的妖怪便開始糾纏他，希望要回自己的名字。因緣際會下，夏目與一個妖怪招財貓結成了奇怪的夥伴關係，並將自己的外婆因為寂寞而與眾妖怪們達成的「主僕」契約--「友人帳」上的妖怪姓名一一歸還…
描述擁有靈異體質的高中生夏目，能看見別人所看不到的。當他得到祖母的遺物「友人帳」之後，開始有各式各樣的妖怪找上門。 夏目在得知事情原委之後，決定要將友人帳上的名字一一還給妖怪們。而也想要拿到友人帳的妖怪貓咪老師，則自願當保鑣，保護夏目和友人帳，共同踏上妖怪之旅。
夏目貴志從小就經常看到怪東西，也就是人類俗稱的妖怪。夏目一直以來備受其擾，自從搬到遠房親戚塔子阿姨的家後，與妖怪們的互動居然愈來愈多。無意間，夏目得到一本由外婆留下的妖怪名冊，並且常常聽到「夏目大人，請把名字還給我吧！」，為了取回友人帳裡的名字，妖怪們總是日以繼夜的前來…
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圍繞桃夭、柳公子、磨牙一行在京師的遊歷。無論是桃夭與丁三四的互動，還是老張帶給柳公子跨越人生和廚藝的指點，亦或是磨牙面對傒囊時的左右為難，都讓一行人各自獲得新的成長。而同時，封無樂，陳白水等人也獲得各自的救贖，或許人生旅途就是這般互相影響，五味雜陳。
桃夭帶著小和尚磨牙、小狐妖滾滾和桃都老鄰居柳公子一起繼續為了尋找失蹤的百妖譜而雲遊四方，在途中遇到暗刀、百知、風果、孰湖、楓生、躉魚六個妖怪，為妖怪治療各種疑難雜症的故事。
