《假面騎士 GEATS》的故事中,為了自神祕的敵人「邪魔徒」手中保護城市和平,主角們將變身為假面騎士,參加名為「願望大賽」擊潰敵人獲得點數,藉由成為競賽的贏家獲取「實現理想世界」的權利。
200年前,超元世界的人類和來自其他世界的怪獸發生了戰爭。為了對抗強大的怪獸,人類發明了超元卡裝置,將怪獸封印在超元卡中,結束了戰爭。主人公雲天曾是一位熱愛超元卡比賽的少年,但是體質特殊的他無法控制好超元卡中的怪獸能量。一天,他意外從爸爸發掘的古遺跡中獲得了一個神奇的卡盒。雲天決定前往尋找4張傳說超元卡,希望用向超元卡許願的方式找回哥哥。就這樣,雲天告別了父母,踏上旅程。