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《假面騎士 GEATS》的故事中，為了自神祕的敵人「邪魔徒」手中保護城市和平，主角們將變身為假面騎士，參加名為「願望大賽」擊潰敵人獲得點數，藉由成為競賽的贏家獲取「實現理想世界」的權利。

朝倉陸，超人力霸王貝利亞的遺傳因子繼承者。在巨大怪獸骷髏哥摩拉的襲擊下逃跑的朝倉陸與夥伴貝加，發現位於地下500公尺的謎之祕密基地。基地的報告管理系統・蕾姆將「Geed Riser」與「Ultra 膠囊」給予了陸，自幼憧憬著英雄的他，決意融合變身成超人力霸王捷德。

200年前，超元世界的人類和來自其他世界的怪獸發生了戰爭。為了對抗強大的怪獸，人類發明了超元卡裝置，將怪獸封印在超元卡中，結束了戰爭。主人公雲天曾是一位熱愛超元卡比賽的少年，但是體質特殊的他無法控制好超元卡中的怪獸能量。一天，他意外從爸爸發掘的古遺跡中獲得了一個神奇的卡盒。雲天決定前往尋找4張傳說超元卡，希望用向超元卡許願的方式找回哥哥。就這樣，雲天告別了父母，踏上旅程。